一些科每个种类的蜥蜴中都有一些蜥蜴只有单性个体。在同时具有雄性和雌性的种类中，雌雄进行交配，体内受精。雄性会将它们一对半阴茎中的一个插入雌性的繁殖管道中，雄性分离的繁殖管道每一部分都有一个睾丸，位于体腔中间或靠近中部的地方。
蜥蜴怎么交配
部分蜥蜴繁殖时都用卵生的方式，繁殖时间一般是在春季末期夏季初期的时候。具体来看，蜥蜴受精时采用的是体内受精的繁殖方式。当繁殖季节到来的时候，雄性的蜥蜴会用交接器跟雌性蜥蜴交配，完成受精这一过程。因为精子的活性比较高，所以雌蜥蜴在一次交配后可以产卵很多次，有时甚至可以连续几年产卵。接下来是雌蜥蜴产卵的过程。他们会先找到一个温暖、潮湿、不易被天敌发现的隐蔽地方，然后产卵。雌性蜥蜴每次产卵的数量都不同，一般来说是在一枚至十几枚之间不等。
蜥蜴的品种比较多，并不是所有的蜥蜴都是卵生的，还有一部分种类的繁殖方式有所不同，是卵胎生。受精的过程跟卵生方式差不多，但受精卵是在雌性体内发育的。虽然如此，但卵胎生并不是胎生，幼体的营养并不是由母体的胎盘直接提供的，而是由卵自身提供的。母体内部可以为受精卵的发育提供适宜的环境，因此幼体成活的概率是比较高的。